La flora è di tipo mediterraneo. La pianta che riveste maggiore interesse è il citiso delle Eolie detto “sgurbiu”, una leguminose endemica i cui esemplari rappresentano il 60% del patrimonio mondiale della specie.
Altre piante rappresentative:
Cisto detto “ruseddu”; Artemisia detta “ierva janca” Ginestra Odorosa detta “frasca”; Ginestra Tirrenica detta “fascina”; Euforbia Arborescente; Canna detta “cannizzula” (usata in passato per delimitare i vigneti o come frangivento, ha oggi invaso buona parte del territorio, in special modo la zona sopra punta Labronzo); Leccio detto “ilici”.
La fauna è molto povera a Stromboli, ma è possibile trovare alcune specie molto interessanti come la lucertola delle Eolie, che vive sull’isolotto di Strombolicchio.
Altri vertebrati: Biacco; Gheppio; Falco della Regina; Gabbiano Reale Mediterraneo; Barbaggianni; Assiolo; Corvo Imperiale; Coniglio.